האוויר הדחוס הנפלט על ידי משאבות ואקום ומדחסי אוויר דורש עיבוד להסרת זיהומים, לחות ומזהמי שמן, ובכך לענות על הדרישות התפעוליות הספציפיות של תעשיות שונות. שלבי עיבוד נפוצים כוללים סינון, ייבוש והסרת שמן.
ראשית, הסינון משמש כשלב היסוד. האוויר הדחוס עובר תחילה דרך-מסנן מראש (בדיוק של 5-10 מיקרומטר) כדי להסיר חומר חלקיקי גדול-כגון אבק וחלודה-וזיהומים אחרים, ובכך למנוע נזק לציוד במורד הזרם. לאחר מכן הוא עובר דרך מסנן דיוק (בדיוק של 0.1-1 מיקרומטר) כדי לסנן זיהומים עדינים יותר ולהבטיח טוהר האוויר. תעשיות כמו מזון וייצור רפואי, הדורשות סביבות סטריליות, חייבות להשתמש במסנני דיוק אולטרה{10}(בדיוק של 0.01 מיקרומטר) כדי לעמוד בתקנים אספטיים מחמירים.
שנית, ייבוש משמש כדי להסיר לחות. כאשר אוויר דחוס מתקרר, הוא מייצר עיבוי; יש להסיר את הלחות הזו באמצעות מייבש. מייבשי ספיחה יכולים להוריד את נקודת הטל של האוויר מתחת ל-40 מעלות, מה שהופך אותם למתאימים ליישומים עם דרישות יובש גבוהות (למשל, ייצור אלקטרוניקה ומכשור פנאומטי). מייבשי קירור משיגים בדרך כלל נקודת טל של 2-10 מעלות; אלה מתאימים ליישומים תעשייתיים כלליים, מסוגלים לענות על הצרכים של רוב הכלים הפנאומטיים תוך מזעור קורוזיה וסתימת צינורות וציוד הנגרמים על ידי לחות.
לבסוף, הסרת שמן היא תהליך שתוכנן במיוחד עבור מדחסי אוויר משומנים-שמן. זה מושג באמצעות מסננים להסרת שמן -(כגון מסנני פחם פעיל) כדי לספוח מזהמי שמן מהאוויר, ובכך להפחית את תכולת השמן השיורית מתחת ל-0.01 מ"ג/מ"ר. למרות שמדחסי אוויר ללא שמן- אינם דורשים הסרת שמן, עדיין יש לנטר את תפוקת האוויר שלהם מעת לעת לגבי תכולת השמן כדי להבטיח עמידה בתקנים התפעוליים. לאחר מכן, האוויר הדחוס המעובד מופנה למיכל קולט אוויר כדי לייצב את הלחץ ולמזער את התנודות, ובמקביל להקל על ההפרדה הנוספת של הקונדנסט. יש לנקז את מיכל קולט האוויר מעת לעת כדי למנוע הצטברות לחות. דרישות העיבוד משתנות בין התעשיות; למשל, מגזרי המזון והרפואה חייבים לעמוד בתקני היגיינה מחמירים, בעוד שתעשיית האלקטרוניקה דורשת רמות גבוהות של טוהר ונקודות טל נמוכות. כתוצאה מכך, יש להגדיר ציוד לטיפול באוויר בהתאם לצרכים תפעוליים ספציפיים כדי להבטיח שאיכות האוויר הדחוס עומדת בעקביות בתקנים הנדרשים.

